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        Horticulture Research| DAP-seq技術(shù)助力揭示MeJA緩解桃果實冷害的分子機制

        更新時間:2026-03-30   點擊次數(shù):119次

        2025年11月3日,Chinese Academy of Agricultural Sciences鄭州果樹研究所桃遺傳育種團隊在Horticulture Research(IF = 8.5)上發(fā)表了一篇題為“JAZ2/JAZ4-MYC2.1 Module Mediates MeJA-Induced Alleviation of Chilling Injury in Peach Fruit (Prunus persica)"的研究論文。該文章借助DAP-seq技術(shù),揭示了JAZ2/JAZ4-MYC2.1模塊介導MeJA緩解桃果實冷害的分子機制。藍景科信為該研究提供了DAP-seq技術(shù)支持。

        Horticulture Research| DAP-seq技術(shù)助力揭示MeJA緩解桃果實冷害的分子機制

        Prunus persica)作為典型的躍變型果實,因風味佳、營養(yǎng)豐富占據(jù)重要市場地位,但采后冷藏易引發(fā)冷害(CI),表現(xiàn)為表面凹陷、內(nèi)部褐變(IB)、成熟受阻等癥狀,其中內(nèi)部褐變主要由酚類物質(zhì)的酶促氧化導致,嚴重降低果實商品性。茉莉酸甲酯(MeJA)作為植物信號分子,已被證實可增強多種果實的耐冷性,其作用與乙烯合成、抗氧化能力提升等生理過程相關(guān),但MeJA介導桃果實耐冷性的分子機制,尤其是關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子MYC2的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)及JAZ蛋白的調(diào)控作用,尚未明確。

        主要研究結(jié)果

        核心發(fā)現(xiàn)一:生理層面驗證MeJA冷功效

        采用1 mM MeJA浸泡處理‘CP9’桃果實15 min,4℃冷藏28天并系統(tǒng)檢測冷害癥狀及生理指標。結(jié)果表明,MeJA處理顯著抑制果實內(nèi)部褐變(IB)發(fā)展,顯著提高乙烯釋放量,同時促進茉莉酸(JA)和JA-Ile積累;果實中總酚、類黃酮等抗氧化物質(zhì)含量顯著升高,丙二醛(MDA)、活性氧(ROS)積累速率及多酚氧化酶(PPO)、過氧化物酶(POD)活性顯著降低,有效緩解低溫誘導的氧化損傷和組織劣變。

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        圖1 外源茉莉酸甲酯(MeJA)處理緩解桃果實冷害(CI)癥狀

        核心發(fā)現(xiàn)二:基因組水平解析核心轉(zhuǎn)錄因子PpMYC2.1調(diào)控桃果實耐冷三重響應通路

        1、鎖定PpMYC2.1為冷核心調(diào)控因子

        通過對MeJA處理組和對照組不同冷藏時間的果實進行RNA-seq分析,鑒定差異表達基因(DEGs),并結(jié)合系統(tǒng)發(fā)育分析、組織特異性表達譜檢測。結(jié)果發(fā)現(xiàn),兩個MYC2(茉莉酸信號分子開關(guān))同源基因中,僅PpMYC2.1MeJA處理和冷藏期間被持續(xù)顯著誘導,且其表達量與乙烯合成、多酚和類黃酮積累呈正相關(guān),而PpMYC2.2表達量低且呈負相關(guān)。免疫印跡分析證實,MeJA處理可誘導PpMYC2.1蛋白積累,且亞細胞定位顯示PpMYC2.1定位在細胞核。以上結(jié)果表明,PpMYC2.1是MeJA誘導桃果實耐冷性的重要調(diào)控因子,通過整合調(diào)控乙烯信號通路和抗氧化物質(zhì)合成發(fā)揮作用。

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        圖2 PpMYC2.1在茉莉酸甲酯(MeJA)介導的桃果實茉莉酸(JA)信號通路中發(fā)揮作用

        2、全基因組鑒定PpMYC2.1靶基因

        為鑒定PpMYC2.1的靶基因,研究開展了DNA親和純化測序(DAP-seq)。結(jié)果顯示,PpMYC2.1在桃基因組中存在9752個高置信度結(jié)合峰,主要富集于轉(zhuǎn)錄起始位點(TSS)上游1000bp區(qū)域,其結(jié)合基序為CAC[G/A]TG,與經(jīng)典G-box基序高度相似。進一步結(jié)合RNA-seq數(shù)據(jù)分析獲得1920個PpMYC2.1直接靶基因;GO富集分析顯示,這些基因顯著富集于苯丙烷生物合成過程、JA介導的信號通路、乙烯響應及細胞壁大分子分解代謝過程,涉及乙烯合成、細胞壁降解和苯丙烷代謝等關(guān)鍵通路。

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        圖3 DAP-seq與RNA-seq數(shù)據(jù)聯(lián)合分析鑒定到受PpMYC2.1調(diào)控的直接靶基因

        3、PpMYC2.1調(diào)控三大耐冷關(guān)鍵通路

        通過DAP-seq和RNA-seq聯(lián)合分析,篩選乙烯信號通路關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(PpIAA1、PpERF61、PpHB.G7細胞壁降解相關(guān)基因(PpPL1、PpPG2、PpXTH2)以及苯丙烷代謝途徑關(guān)鍵基因(PpPAL1Pp4CL、PpCHI3PpCHS通過Y1H、EMSA、DLR及桃果實瞬時過表達和沉默實驗證實,PpMYC2.1可直接結(jié)合上述基因的啟動子區(qū)域并調(diào)控其表達,表明PpMYC2.1在介導MeJA誘導的桃果實耐冷性中發(fā)揮核心作用。

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        圖4 PpMYC2.1介導的桃果實乙烯合成相關(guān)關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子(TFs)的直接調(diào)控

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        圖5 PpMYC2.1介導的桃果實細胞壁降解關(guān)鍵基因的直接調(diào)控

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        圖6 PpMYC2.1介導的桃果實多酚和類黃酮合成關(guān)鍵基因的直接調(diào)控

        核心發(fā)現(xiàn)三:PpJAZ2/4-MYC2.1模塊調(diào)控機制與PpMYC2.1冷功能的多維驗證

        1、PpJAZ2/4-PpMYC2.1模塊在介導MeJA誘導的桃果實冷適應中的功能

        JAZ-MYC模塊是JA信號通路中的核心調(diào)控機制,其中JAZ蛋白作為抑制因子,通過直接結(jié)合并抑制MYC轉(zhuǎn)錄因子(TFs)的活性,進而調(diào)控下游基因表達。通過系統(tǒng)篩選桃基因組JAZ家族基因,結(jié)合轉(zhuǎn)錄組分析、蛋白水平檢測鎖定PpJAZ2/4為候選調(diào)控因子。利用酵母雙雜交(Y2H)、熒光素酶互補成像(LCI)、雙分子熒光互補(BiFC)及免疫共沉淀(Co-IP)等實驗證實,PpJAZ2/4PpMYC2.1存在直接物理相互作用,且二者均定位于細胞核;雙熒光素酶報告基因(DLR)實驗進一步表明,PpJAZ2/4可顯著抑制PpMYC2.1對下游靶基因啟動子的激活活性,而MeJA處理能顯著下調(diào)PpJAZ2/4的轉(zhuǎn)錄與蛋白水平,解除其對PpMYC2.1的抑制效應。

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        圖7 PpJAZ2/4抑制PpMYC2.1對其下游靶基因的轉(zhuǎn)錄活性

        2、PpMYC2.1跨物種功能驗證

        為驗證PpMYC2.1在調(diào)控冷害中的功能作用,本研究構(gòu)建PpMYC2.1過表達轉(zhuǎn)基因番茄,株系,并對野生型和轉(zhuǎn)基因番茄果實進行4℃冷藏28天處理,檢測冷害癥狀及相關(guān)理化和分子指標。結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)基因番茄冷害指數(shù)顯著低于WT,乙烯合成量顯著提升,果實硬度適度下降,MDA和ROS積累減少,總酚、類黃酮含量升高,且乙烯合成(SlACS2、SlACO1)、細胞壁降解(SlPL1SlXTH3)及苯丙烷代謝(SlPAL1、SlCHS1)相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄水平顯著上調(diào)。以上結(jié)果表明,PpMYC2.1的耐冷功能在不同果實物種中具有保守性。

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        圖8 轉(zhuǎn)基因番茄果實中PpMYC2.1過表達增強耐冷性

        小結(jié)

        本研究通過多組學技術(shù)(RNA-seq、DAP-seq)與分子生物學實驗相結(jié)合,完整揭示了“MeJA下調(diào)PpJAZ2/4表達→解除對PpMYC2.1的抑制→激活乙烯合成、細胞壁重塑及多酚類黃酮合成通路→增強果實冷性"的分子調(diào)控鏈。這一發(fā)現(xiàn)不僅填補MeJA介導桃果實耐冷害分子機制的研究空白,更為躍變型果實采后冷鏈物流優(yōu)化提供了關(guān)鍵分子靶點,為開發(fā)高效、綠色的保鮮技術(shù)奠定了堅實的理論基礎(chǔ)。

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        圖9 闡明PpMYC2.1在提升耐冷性中正向調(diào)控作用的工作模型

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